水产品种创制与高效养殖全国重点实验室依托中国科学院水生生物研究所，以原"淡水生态与生物技术国家重点实验室"为主体，整合中国科学院海洋研究所、南海海洋研究所相关优势力量于2025年1月完成重组工作，正式更名为"水产品种创制与高效养殖全国重点实验室"。

水产品种创制与高效养殖全国重点实验室面向国家"粮食安全与蛋白有效供给"这一重大战略需求，围绕农业领域中的"水产育种"重点布局方向，针对水产养殖中品种种质退化、病害频发、饲料争粮等突出问题与挑战，瞄准水产动物重要性状形成与耦合的遗传机制重大科学问题，聚焦全基因组选择和重构、基因编辑、性别控制、可控不育与借腹生殖等精准育种前沿技术，创制突破性新品种，实现种源自主可控，构建绿色高效的精准养殖技术体系，建成国际一流的科技创新平台和人才培养高地，推进我国水产绿色、高效的可持续发展，为保障我国优质蛋白有效供给提供不可替代的科技支撑。

开创我国水生生物学研究领域、引领水产学基础研究：先后产生中国科学院、中国工程院院士共16位。出版《中国鲤科鱼类志》、《中国动物志》、《中国淡水鱼类养殖学》、《中国海洋生物名录》等。创制世界首例体细胞克隆动物（克隆鱼），研制世界首例转基因鱼，提出了转基因鱼形成的模型理论，被载入《世界科学年史》。是我国淡水鱼类养殖学、鱼病学等研究领域发源地，出版新中国首本“养鱼经”，创建我国首个鱼病工作站。

破解物种演化和性状形成遗传机制，为水产物种重要性状改良提供理论基础：在贝类环境适应性、鲫多倍体与生殖特性、鱼类生殖调控机制、抗病抗逆等取得一系列突破进展。“脊椎动物从水生到陆生演化的遗传创新机制”入选2021年中国生命科学十大进展。利用斑马鱼实现首例脊椎动物整条染色体的系统性基因敲除，构建首个规模化反向遗传学鱼类遗传育种模型库，入选国家十三五科技创新成就展；助力我国首次成功实现太空养鱼，开辟水产育种新赛道，国家斑马鱼资源中心科技支撑能力超过美国跃居全球首位。“银鲫天然雌核发育机理研究”和“多倍体银鲫独特的单性和有性双重生殖方式的遗传基础研究”分别获国家自然科学二等奖（1995和2011年），“鱼类能量学机制的研究”获国家自然科学三等奖（1999年）。海参、文蛤、鹦鹉螺等物种多样性及性状演化研究入选2021和2022年度“中国海洋与湖沼十大科技进展”。

创建精准育种技术，培育重要性状新品种：培育了国审水产新品种41个，有力引领了我国水产业健康发展。首次培育转“全鱼”生长激素基因鲤鱼家系，生长速度快，饵料转化效率高，具有完全自主知识产权的“冠鲤”。创建基因组重构等育种技术、培育系列银鲫新品种；其中异育银鲫“中科3号”和“中科5号”等系列新品种占全国鲫主养区总量70%左右，近5年年增产值近100亿元。历经28年选育出“四大家鱼”鳙（花鲢）的首个国审新品种“中科佳鳙1号”。引领海带、对虾和扇贝为代表的海水养殖三次浪潮，创建了海带夏苗技术，引进了海湾扇贝，突破了南美白对虾及扇贝培育和人工繁育的若干关键技术，奠基了我国的海带、南美白对虾和扇贝产业。研发了海水养殖动物多倍体育种育苗和性控技术，创建了国内第一个牡蛎四倍体专利技术，培育了3种国内大宗养殖牡蛎四倍体品系。培育了第一个海水贝类新品种“大连1号”杂交鲍；第一个龙须菜新品种“981”龙须菜；第一个滩涂贝类新品种“科浙1号”文蛤；以及适应全球气候变化，创制的耐高温、度夏成活率高的“东科1号”刺参；利用海带克隆杂交制种技术培育了性状稳定的“中宝1号”海带新品种。

开创国际领先的绿色高效养殖模式、 引领全国生态高效水产养殖模式时代浪潮：首创稻鱼互利共生理论和技术体系，开创稻渔综合种养研究新方向，倪达书等于50年代首次提出，90年代 出版《稻田养鱼的理论与实践》著作。首创大水面生态渔业理论体系、技术模式并进行场景化示范，成功打造千岛湖、查干湖等大水面养殖经典案例，成为践行习近平总书记“两山理论”的生动样本。相关成果先后获得国家科技进步奖6次，入选改革开放40周年渔业科技50项标志性科技成果。

建言建策：首倡的长江“十年禁渔”写入二十大报告，成为国际大河流域水生生物资源保护的独特中国范例：长江水生生物多样性稳步提升，2023年长江流域监测到土著鱼类227种，同比增加34种。制定了首个海洋牧场建设与修复国家标准，为国家种业安全做出了突出贡献，海洋牧场技术成果2017年入选国家“砥砺奋进的五年”大型成就展，2019年入选中国科学院改革开放四十周年四十项标志性科技成果，2021年国家 “十三五”科技创新成就展农业展区唯一涉海展品。

国际影响：《纽约时报》发表长篇述评（1990年），称朱作言先生的鱼类基因工程研究成果领先美国3年，该成果也被1991年美国出版的《世界科学年史》记录为近代中国两大重要开拓性科研成果之一。2015年《科学美国人》采访中国科学院水生生物研究所等专家学者，调研中国可持续渔业及战略，专刊发表评述“Fishing for Billions”（“中国水产养育了几十亿人”）。桂建芳院士等主编英文专著《AQUACULTURE IN CHINA》讲述中国水产养殖成功故事走向世界，被欧美专家誉为“现代养鱼经”。

   建立了一支结构合理、创新强劲的高水平科研队伍：现有固定人员105人，其中研究人员99人，技术人员6人。研究人员中有中国科学院院士3人；国家杰出青年科学基金获得者8人，优秀青年科学基金获得者7人，优秀青年科学基金获得者（海外）1人；入选国家海外高层次人才引进计划青年人才1人；入选国家高层次人才特殊支持计划百千万工程领军人才3人、科技创新领军人才3人、青年拔尖人才4人；有1个国家自然科学基金创新研究团队、1个科技部重点领域创新团队。